Zdravotnická s.r.o. má v Česku specifické postavení: většina jejích výkonů je podle § 58 zákona o DPH osvobozena od daně z přidané hodnoty, avšak bez nároku na odpočet daně na vstupu. Zároveň platí běžnou daň z příjmů právnických osob a řídí se stejnými pravidly pro odpisy majetku a uznatelnost nákladů jako každá jiná firma. Právě tato kombinace dělá účetnictví lékařské, zubní nebo fyzioterapeutické ordinace svébytným.
Lékaři, zubaři a fyzioterapeuti stále častěji podnikají přes s.r.o. namísto samostatné praxe fyzické osoby. Důvody jsou praktické – oddělení odpovědnosti, snazší nábor personálu i přehlednější financování přístrojů. Účetní a daňová pravidla se však v mnohém liší od běžné obchodní firmy a podcenit je se nevyplácí.
Kdy je zdravotní služba osvobozena od DPH?
Poskytování zdravotních služeb je podle § 58 zákona č. 235/2004 Sb., o DPH osvobozeno od daně. Rozhodující je, zda jde o činnost s léčebným cílem nebo činnost chránící lidské zdraví, poskytovanou oprávněným poskytovatelem zdravotních služeb. Při splnění této podmínky nezáleží na tom, zda výkon hradí pacient přímo, nebo zdravotní pojišťovna.
Osvobození má ovšem důležitý háček: jde o osvobození bez nároku na odpočet DPH na vstupu. Ordinace tedy neúčtuje DPH na výstupu, ale zároveň si nemůže nárokovat odpočet DPH z nákupu přístrojů, materiálu, energií či softwaru. DPH se tak stává reálným nákladem, který vstupuje do pořizovací ceny majetku i do provozních výdajů. Při nákupu rentgenu za 750 000 Kč bez daně firma reálně zaplatí přes 900 000 Kč a odpisuje celou tuto částku.
Které výkony naopak podléhají DPH?
Ne každý výkon v ordinaci má léčebný cíl. Podle výkladu Soudního dvora EU i Finanční správy jsou od DPH osvobozeny jen výkony směřující k prevenci nebo léčbě. Čistě estetické zákroky bez léčebného záměru – estetická plastika, aplikace výplní z kosmetických důvodů či estetická stomatologie nad rámec léčby – osvobozeny nejsou a podléhají základní sazbě DPH 21 %.
Do zdanitelných plnění mohou spadat i některé další činnosti – posudky pro komerční účely, pronájem prostor jiným lékařům nebo prodej doplňkového zboží. Pokud obrat z takových plnění překročí 2 000 000 Kč za kalendářní rok, vzniká povinnost registrace k DPH. Smíšený provoz, kde se střídají osvobozené a zdanitelné výkony, pak vede odpočet daně přes tzv. koeficient a je znatelně náročnější na evidenci.
Jak se odpisuje zdravotnická technika?
Přístroje a vybavení ordinace jsou hmotným majetkem, který se odpisuje podle zákona o daních z příjmů. Majetek s pořizovací cenou nad 80 000 Kč a dobou použitelnosti nad jeden rok nelze dát do nákladů najednou – jeho cena se rozpouští do výdajů postupně přes odpisy. Zdravotnické přístroje spadají zpravidla do druhé odpisové skupiny s dobou odpisování pět let.
Příklad: zubní souprava za 600 000 Kč se při rovnoměrném odpisování promítne do daňových nákladů řádově po 120 000 Kč ročně během pěti let. Drobnější vybavení do 80 000 Kč (nástroje, menší přístroje) si firma může uplatnit do nákladů jednorázově. Podrobněji o tom, co vše si můžete dát do nákladů firmy, píšeme v samostatném článku.
Které náklady si lékařská s.r.o. může uplatnit?
Kromě přístrojů a spotřebního materiálu má zdravotnická s.r.o. řadu výdajů, které přímo souvisejí s výkonem povolání a jsou daňově uznatelné:
- Povinné celoživotní vzdělávání – lékaři se musí soustavně vzdělávat; kurzy, kongresy a odborná literatura jsou nákladem firmy.
- Členské příspěvky v komoře – členství v České lékařské komoře (případně stomatologické) je podmínkou výkonu povolání.
- Pojištění odpovědnosti za újmu – poskytovatel zdravotních služeb musí být ze zákona pojištěn pro případ újmy způsobené při poskytování péče.
- Zdravotnický materiál a léčiva spotřebované při výkonech, dezinfekční a čisticí prostředky.
- Nájem ordinace, energie, úklid a odvoz zdravotnického odpadu.
U každého výdaje platí základní pravidlo uznatelnosti – musí souviset s dosahováním příjmů a být řádně doložen dokladem. Jak k nákladům přistupovat systematicky, shrnujeme v textu o optimalizaci nákladů firmy.
Jaké daně platí zdravotnická s.r.o. v roce 2026?
Ze zisku platí zdravotnická s.r.o. daň z příjmů právnických osob se sazbou 21 %, která platí i pro rok 2026. Po zdanění může jednatel – lékař vyplatit zisk formou podílu na zisku (dividendy), jenž se zdaňuje samostatně srážkovou daní.
Zda se vyplatí vyplácet odměnu jednatele, nebo podíl na zisku, závisí na výši příjmu a odvodovém zatížení a je vhodné to propočítat individuálně. Souvislosti účetnictví s.r.o. a rozdíly mezi trhy přibližuje také článek Účetnictví s.r.o. v roce 2026: Slovensko vs Česko.
Na co si dát pozor u hotovosti a evidence?
Na rozdíl od dřívějška již v Česku neplatí elektronická evidence tržeb – EET byla zrušena k 1. lednu 2023. Ordinace přijímající platby v hotovosti od samoplátců tak nemají povinnost tržby elektronicky evidovat, musí je však řádně zaznamenat v účetnictví a doložit doklady.
Důsledné oddělení osvobozených a zdanitelných výkonů, správné zařazení majetku a poctivá evidence dokladů jsou základ, který při případné kontrole rozhodne. Zdravotnická s.r.o. není složitější než jiná firma, ale kombinace osvobození od DPH bez odpočtu a přísné regulace povolání vyžaduje účetního, který specifika oboru zná.
Zvažujete založení ordinace jako s.r.o. nebo řešíte DPH, odpisy a hranici osvobozených výkonů ve fungující praxi? Rádi vám nastavíme účetnictví i daňový režim na míru zdravotnickému oboru.
Časté dotazy
Musí lékařská s.r.o. platit DPH?
Z výkonů zdravotní péče s léčebným cílem ne – ty jsou podle § 58 zákona o DPH osvobozeny. DPH se však týká výkonů bez léčebného záměru, například čistě estetických zákroků nebo komerčních posudků. Pokud obrat z takových zdanitelných plnění překročí 2 000 000 Kč za kalendářní rok, ordinace se musí registrovat k DPH.
Může si zdravotnická s.r.o. nárokovat odpočet DPH z nákupu přístrojů?
U osvobozených zdravotních výkonů ne. Jde o osvobození bez nároku na odpočet, takže DPH z nakoupených přístrojů, materiálu a služeb je pro ordinaci reálným nákladem a vstupuje do pořizovací ceny majetku. Odpočet je možný jen v rozsahu zdanitelných plnění, zpravidla přes koeficient.
Do jaké odpisové skupiny patří zdravotnická technika?
Zdravotnické přístroje se zpravidla zařazují do druhé odpisové skupiny s dobou odpisování pět let. Majetek s cenou nad 80 000 Kč a použitelností nad jeden rok se musí odpisovat postupně, drobnější vybavení pod tuto hranici lze dát do nákladů jednorázově.